环保督察对环境监管带来重大影响的同时，也遭受“一刀切”非议。“所谓‘一刀切’，从来就不是环保部的要求。”环保部政策法规司司长别涛日前表示，对违法企业要“零容忍”严格执法，这是法治的基本要求。
据别涛介绍，京津冀及周边地区“2+26”城市大气污染防治强化督查正在持续开展，根据环保部调度，督察组在京津冀地区发现的问题企业至少有17万余家，“这个数字是非常惊人的。”
但是，网络上也出现了一些针对环保督查的负面舆论：“环保重压之下，风暴所到之处，包括化工行业企业在内，企业大面积断水断电停产，工人停工失业，家庭生计堪忧！有点哀鸿遍野的味道。”一篇题为“大面积停产、失业、民怨沸腾！国社发文质疑‘环保风暴’一刀切”的博文说，很多中小化工企业主全部身家都压在工厂里，而无数工人正背负着房贷、车贷、养家、养老的巨大压力，政府采取一刀切式整治令不少无污染企业也被强制关停。
“我们从来没有要求环保部门‘一刀切’，相反，据我所知，部领导有两个态度是明确的：一是反对部分地方在平时疏于监管，使违法企业长期存在，污染环境这种现象环保部是坚决反对的，因为它表现为不作为；二是反对部分地方平时不作为，到了环保督察检查巡查时采取简单粗暴的方法，片面处理发展与环保的关系，这是严重的不负责任，也是滥作为。”别涛解释称，环保部反对平时不作为，也反对检查时的滥作为。
“企业发生的问题，从法律角度分析，很多是未批先建、批建不符，环保设施未验收或没有正常运行，超标或超总量排污，也可能是没有排污许可证，还有的是环保部门责令改正之后拖延消极，拒不整改。”别涛表示，违法的表现如此种种不一而足，“对这些行为，我们是不应该容忍的。对违法企业，我们的法律法规有相应的处罚规定。”
别涛表示，一些违法行为无视法纪，只管自己盈利，损害了公共环境，也破坏市场公平竞争。“我们现在主要是抓大企业，但是对一些散乱污企业，它的环保成本基本等于零。这就导致同样一个产品，违法企业的实际成本很低，与守法企业的市场竞争是不公平的。因此，通过严格执法，使企业去掉侥幸心理，同时还守法企业一个公道，让守法企业不吃亏，让违法企业不占不应占的便宜。这是法律规定的基本理念。”
别涛介绍，从法律上看，环境监管执法应该有3个原则：一是对违法企业应坚持零容忍，严格执法，公平执法；二是对环保守法企业，应该公正对待，依法保护合法经营权；三是对违法企业，从依法行政角度，也要遵守法律规定的条件程序，分类管理，合理引导，依法合理行政。